هنگامی که ملکه ویکتوریا سنگ بنای ساختمان جدید برای موزه هنر را گذاشت، گفتکه امکان تغییر نام موزه  پس از او و همسر مرحومش وجود دارد. این  امر ابتدا در کل موزه مورد استفاده قرار گرفت، اما زمانی که این ساختمان جدید ده سال بعد بازگشایی شد، این عنوان به مجموعه‌های هنری محدود شد و مجموعه‌های علمی از آن جدا شدند.

موزه علم در تاریخ ۲۶ ژوئن سال ۱۹۰۹ میلادی به عنوان یک نهاد مستقل شکل گرفت البته سر ریچارد آلیسون بعد‌ها موزه علوم معاصر را طراحی کرد. این موزه در ساختمان بلوک شرق تأسیس شد.

موزه علوم معاصر لندن در سال‌های بعد از افتتاح گسترش پیدا کرد. این موزه محل مناسبی برای نگهداری از قدیمی‌ترین باقی مانده لوکوموتیو بخار است. لوکوموتیو بخار، لوکوموتیوی است که با موتور بخار کار می‌کند. نخستین لوکوموتیو بخار در سال ۱۸۰۴ میلادی ساخته شد.

گفتنی است، یکی از قسمت‌های موزه علوم معاصر لندن در گذشته، کتابخانه ملی انگلیس برای علوم، پزشکی و تکنولوژی بود. این قسمت موزه هم‌اکنون یک کتابخانه اختصاصی است که دانشمندان سراسر جهان از آن استفاده می‌کنند.